Η Μεσοχώρα είναι ένα κατάφυτο χωριό με πλούσια χλωρίδα. Μεγάλο ποσοστό της συνολικής της έκτασης είναι δασώδης. Υπάρχουν δάση ελάτης και δάση φυλλοβόλων πλατύφυλλων – δρυός. Κυρίαρχο είδος είναι ο έλατος. Σημαντική θέση κατέχουν ο πλάτανος, η ιτιά, ο κέδρος, ο σφένδαμος, πολλά οπωροφόρα όπως καρυδιές, κερασιές, κορομηλιές, αχλαδιές, κρανιές, μηλιές, φουντουκιές, κυδωνιές, κληματαριές και μεγάλη ποικιλία άγριων και σπάνιων μανιταριών.

Στα βουνά της κοιλάδας του άνω ρου Αχελώου και στα δάση της φιλοξενούνται  πλήθος άγριων ζώων, όπως η γνωστή καφέ αρκούδα της Πίνδου, λύκος, αγριόχοιρος, αλεπού, λύγκας, ζαρκάδι, ελάφι, αγριόγιδο, άγριο άλογο, ασβός, κουνάβι, σκίουρος, νυφίτσα, χελώνα, σκαντζόχοιρος, λαγός, αγριόγατα, ποικιλία φιδιών, σαυρών και αμφιβίων.

Σημαντική επίσης είναι και η πτηνοπανίδα της περιοχής με αετούς, σταυραετούς, χρυσαετούς, γυπαετούς, γεράκια, γερακίνες, πετρίτες, κούκους, κουκουβάγιες, αηδόνια, τσίχλες, πέρδικες, φασιανούς, μελισσουργούς, κοτσύφια, κοκκινολαίμιδες, κίσσες, καρακάξες, κουρούνες, αγριοπερίστερα, σπουργίτια, πετροχελίδονα, νυχτερίδες κ.α.